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日本首相菅義偉上任後就在「日本學術會議」新會員任命案創先例，拒絕任命其中6人，招致日本學術會議及學界反彈。日本學術會議已寄出請願書，要求菅義偉說明理由並儘速任命。
日本學術會議會員210人，任期6年，每3年改選半數105人。會員產生方式由日本學術會議推薦給首相任命，在改成現行制度以來，會議推薦人選從未創意禮品有未獲任命的前例。
不過，9月16日剛接任首相的菅義偉，僅同意日本學術會議推薦105人名單中的99人，未任命另外6人，也沒板橋鑽石說明理由，僅表示「基於法律所做適當因應結果」。
日本TBS電視台、產經新聞、每日新聞報導，早稻田大學教授小原隆治2日晚間在推特發起抗議活動，3日有數百人響應前往東京都永田町首相官邸前，要求政府保障學術自由，也主張政府無權拒絕任命。
日本學術會議先在2日總會要求菅義偉說明拒絕任命這6人的理由，並彙整出要求任命這6人的請願書大致內容，接著在3日舉行的幹事會定案。
日本學術會議在官網公布請願書電子檔，請願書主要內容有兩點，第一，希望菅義偉說明不任命推薦會員人選的理由；第二，請菅義偉儘速任命未獲任保溫桶FRP命的推薦會員人選。
日本學術會議針對推薦會員人選中有6人未獲任命，昨天正式決定要求菅義偉說明的請願書，並寄出給內閣府。
日本學術會議在2日上午舉行總會已大致同意會長梶田隆章提出的請願書，但之後又進行相關文字修飾等討論。梶田說，希望透過提出質疑來確實理解這6人未獲任命的理由。
由私立大學及短期大學教職員工會組成的保溫桶FRP「日本私立大學教職員組合連合」（簡稱日本私大教連），3日發表緊急聲明批評菅義偉此舉「將在日本學術會議歷史上留下汙點」。
聲明指創意禮品出，如果日本學術會議會員任命是基於政治判斷，「學術會議就會成為政府御用機關，也可能讓日本學術從屬在政治之下」。
其中一位未獲任命的早稻田大學教授岡田正則說，為了不讓日本學術遭到扭曲而留下禍根，希望內閣做出因應；另一位未獲任命的東京慈惠會醫科大學教授小澤隆一說，希望未來也能向大眾說明學術獨立的重要性。
日本內閣官房長官加藤勝信2日在軸承記者會上說，並沒有考量任命這6人。
日本學術會議以獨立立場提供政府政策建言，成員共210人、任期6年，每3年改選半數成員。根據日本學術會議法，會員由會議選拔候選人推薦給首相，首相再根據推薦名單任命。
日本放送協會（NHK）報導，被菅義偉拒絕任命的6名學者，分別是京都大學大學院文學研究科教授蘆名定道（基督教學者）、東京大學教授宇野重規（政治學者）、早稻田大學教授岡田正則（法學學者）、東京慈惠會醫科大學教授小澤隆一（法學學者）、東京大學大學院人文社會系研究科教授加藤陽子（歷史學者），及立命館大學大學院教授松宮孝明（法學學者）。
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